磷酸化蛋白质组
翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，在生命现象的许多关键调节机制中，蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰，它与信号传导，细胞周期，生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。
SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
蛋白样本制备、免疫组化、双向电泳、蓝色温和胶电泳系统分离蛋白质复合体、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测
北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。
相对定量蛋白质组学（SWATH）
SWATH采集模式能够将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂，从而获得完整的肽段信息。美吉生物在该技术方面有丰富的经验。
大肠杆菌的蛋白表达和纯化
义翘神州开发出多种宿主系统，能在大肠杆菌中表达蛋白。通常采用可溶性表达以及包涵体表达系统来表达各种不能糖基化的蛋白质，可以制备克到千克级的可溶性蛋白。
定量蛋白质组学——TMT
TMT是开发的一种多肽体外标记技术。通过对不同样品中的肽段采用不同通道的TMT 试剂进行标记，然后进行LC-MS/MS 分析，通过TMT 标记信号的强度值实现样本蛋白组之间的相对定量。